More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2223 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  396  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 403 aa  71.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  27.98 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3071  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0385264  normal  0.592961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  29.1 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  25 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  25 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  25 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  25 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  21.97 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 205 aa  52  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 264 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  34.29 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  24.49 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  24.49 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 243 aa  52  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  27.15 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 324 aa  51.6  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 231 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  47.37 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 335 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1929  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.434465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1338  TetR family regulatory protein  29.06 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0307  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.45423  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 270 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 257 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1024  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.420909  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0841  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1177  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1185  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.193625  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  24.87 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00480  transcriptional regulator TetR/acrR family  33.83 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>