More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1994 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 173 aa  346  8e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  98.27 
 
 		 173 aa  338  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  98.27 
 
 		 173 aa  338  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  72.84 
 
 		 183 aa  236  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  63.86 
 
 		 184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  63.86 
 
 		 184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  63.86 
 
 		 184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  74.38 
 
 		 187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  63.1 
 
 		 181 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 180 aa  205  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 268 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 237 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  25.13 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  25.13 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  25.13 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  25.13 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  25.99 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 235 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0726  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 201 aa  52  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.892311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  24.6 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 264 aa  52  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 201 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  24.6 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 189 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 201 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 201 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 262 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 236 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 195 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  40.62 
 
 		 220 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 199 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 237 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 209 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 206 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 204 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 209 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 206 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 206 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 184 aa  48.1  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  48.1  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 195 aa  48.1  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 184 aa  47.8  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 204 aa  47.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  35.48 
 
 		 206 aa  47.8  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 214 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 228 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 214 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  34.02 
 
 		 231 aa  47.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  36.56 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 189 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>