More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4112 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  85.33 
 
 		 187 aa  294  6e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  73.46 
 
 		 173 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  73.46 
 
 		 173 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  72.84 
 
 		 173 aa  236  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  59.89 
 
 		 184 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  59.89 
 
 		 184 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  59.89 
 
 		 184 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  61.8 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 180 aa  207  5e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 216 aa  67.8  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 236 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 264 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 197 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 210 aa  52.4  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 181 aa  52  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 217 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 236 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 324 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  35.82 
 
 		 390 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  41.07 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 335 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  40.62 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 438 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 223 aa  48.9  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 278 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 278 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 278 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  48.94 
 
 		 227 aa  48.5  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>