More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0144 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  372  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 181 aa  147  6e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 193 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 193 aa  51.2  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 195 aa  51.2  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0726  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.892311  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 244 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4025  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  32.73 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 251 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  40.43 
 
 		 252 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 242 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  34.43 
 
 		 250 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  22.75 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  48.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  41.51 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 226 aa  47.8  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  32.26 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  20.95 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 260 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0701  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 261 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.684816  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 400 aa  45.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 220 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 247 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 195 aa  45.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0891  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 227 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.735718  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 210 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 241 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 234 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1531  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 227 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.357864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6490  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 243 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  37.74 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 219 aa  45.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 198 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  40.82 
 
 		 230 aa  45.1  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 257 aa  45.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 318 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 212 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 195 aa  44.7  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 318 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 318 aa  44.7  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>