More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2324 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  52.25 
 
 		 196 aa  177  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  50.54 
 
 		 195 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 195 aa  165  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  44.97 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  29.02 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 201 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 224 aa  84.3  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  27.51 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  30.72 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 243 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  27.84 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 204 aa  67  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  32.21 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  25.95 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.65 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.65 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  23.83 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  37.65 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.65 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.65 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.65 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  25.77 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  26.67 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 261 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  24.05 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  40.98 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2556  putative transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.596771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>