More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3154 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  88 
 
 		 200 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  45.5 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  32.84 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  27.32 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  27.44 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.42 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  25.45 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  33.6 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  27.43 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0375  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0366  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0363  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0389  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0433  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  26.9 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  28.57 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  29.32 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  38.46 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  31.4 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  34.74 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  30.58 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  30.58 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  30.58 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  30.58 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>