290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1755 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  61.19 
 
 		 208 aa  240  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  61.78 
 
 		 201 aa  228  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  59.18 
 
 		 207 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  59.18 
 
 		 207 aa  227  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  59.6 
 
 		 200 aa  222  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  47.09 
 
 		 205 aa  167  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  45.18 
 
 		 204 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 203 aa  159  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 205 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 204 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 204 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 196 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 202 aa  90.9  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 205 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 206 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  35.29 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  32.16 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  29.84 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  32.32 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1420  hypothetical protein  41.67 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57852  normal  0.215319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  23.75 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  36.96 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 332 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_2967  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.699652  normal  0.0717993 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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