More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5655 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  71.13 
 
 		 205 aa  298  4e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  68.78 
 
 		 205 aa  296  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  67.8 
 
 		 205 aa  295  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  67.8 
 
 		 205 aa  295  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  67.8 
 
 		 205 aa  295  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  67.8 
 
 		 205 aa  295  3e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  67.8 
 
 		 205 aa  295  4e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  71.65 
 
 		 205 aa  293  9e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  67.19 
 
 		 205 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  67.53 
 
 		 207 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  67.37 
 
 		 204 aa  280  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  63.21 
 
 		 205 aa  256  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  60.82 
 
 		 205 aa  249  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  54.37 
 
 		 206 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  55.67 
 
 		 204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  57.64 
 
 		 204 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 204 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  58.2 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  59.89 
 
 		 205 aa  225  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  54.04 
 
 		 204 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 204 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 205 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  54.44 
 
 		 204 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  45.05 
 
 		 204 aa  194  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  46.19 
 
 		 202 aa  192  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 205 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  33.74 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 203 aa  85.5  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 204 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 196 aa  84.7  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  27.8 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  22.73 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  40.66 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  34.26 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  22.29 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 242 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 371 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 470 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>