224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0918 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  81.58 
 
 		 243 aa  297  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  81.58 
 
 		 243 aa  297  5e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  81.58 
 
 		 243 aa  297  5e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  78.42 
 
 		 242 aa  244  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  76.84 
 
 		 242 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 210 aa  98.2  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 196 aa  77.8  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  31.64 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  25.81 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  27.16 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 209 aa  62  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  25.77 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  26.95 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  21.89 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  29.71 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 217 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 219 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2200  putative regulatory protein TetR  25.79 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.841471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>