More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3759 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  417  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  96.53 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  70.3 
 
 		 201 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 204 aa  154  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 203 aa  147  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  40.76 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 204 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 196 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  37.84 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 204 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  36.43 
 
 		 204 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 204 aa  94  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 195 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 204 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 206 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  32.87 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  30.5 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  30.77 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  29.47 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  25.81 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0829  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  27.54 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
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NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  47.37 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
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NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
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NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
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