More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46570 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  71.22 
 
 		 205 aa  309  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  71.22 
 
 		 205 aa  309  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  69.27 
 
 		 205 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  69.27 
 
 		 205 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  69.27 
 
 		 205 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  68.78 
 
 		 205 aa  294  6e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  72.02 
 
 		 205 aa  293  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  70.98 
 
 		 207 aa  292  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  70.83 
 
 		 205 aa  290  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  70.98 
 
 		 204 aa  289  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  68.91 
 
 		 205 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  63.9 
 
 		 205 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  62.93 
 
 		 204 aa  254  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  59.51 
 
 		 205 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  59.22 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  61.34 
 
 		 204 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 204 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  58.05 
 
 		 204 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  63.04 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  60.73 
 
 		 204 aa  234  8e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  60.99 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  60.8 
 
 		 204 aa  226  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 205 aa  204  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 204 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  32.93 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 209 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  27.16 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 400 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.32 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  27.32 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.32 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.32 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.32 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.32 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  27.32 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  48.08 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  30.07 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 182 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2636  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4517  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000667757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  26.83 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  23.08 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 240 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>