268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6237 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6237  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.250294  normal  0.446462 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  43.84 
 
 		 204 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 205 aa  194  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 204 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 204 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 204 aa  184  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  44.21 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 205 aa  181  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 205 aa  181  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 205 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 204 aa  177  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  46.02 
 
 		 205 aa  175  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  42.11 
 
 		 204 aa  174  9e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5641  regulatory protein, TetR  46.29 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  40.76 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  40.32 
 
 		 205 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 202 aa  95.5  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 202 aa  94.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  27.86 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  58 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  31.37 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  25.97 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  39.74 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 349 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2584  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.130445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  25.83 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 256 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  25.45 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3419  transcription regulation protein  38.46 
 
 		 201 aa  48.9  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.909274  normal  0.462694 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  36.67 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  24.32 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 228 aa  48.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>