More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8100 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  41.95 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  43.69 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  40.44 
 
 		 246 aa  141  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  37.81 
 
 		 213 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 255 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  37.67 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 232 aa  131  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  38.24 
 
 		 264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  41.21 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2371  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.533189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  42.18 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 228 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  29.17 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  36.91 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 125 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.48 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  31.25 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  32.03 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1421  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.216023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 225 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 324 aa  61.6  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28.87 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>