More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3444 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  88 
 
 		 200 aa  360  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  43.92 
 
 		 222 aa  151  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  27.98 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  32.09 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 201 aa  67.8  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.25 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  25 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  26.83 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  26.22 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.43 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  27.38 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  33.88 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  26.79 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0375  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0366  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100088  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0363  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0433  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0389  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4869  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0455  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0937341  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.3 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1902  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  32.23 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00105547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1663  regulator AmrR  32.23 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2056  TetR family regulatory protein  32.23 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1888  multidrug efflux operon transciptional regulator AmrR  32.23 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0318  TetR family regulatory protein  32.23 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0868367  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0842  regulator AmrR  32.23 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.063166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
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NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  43.75 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046251 
 
 
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NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
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NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 228 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
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NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
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NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.82 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
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NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
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NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
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NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
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NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
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NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
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NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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