More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1590 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3326  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3094  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.432559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 185 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0242  regulatory protein, TetR  22.4 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  20.83 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3261  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0546  regulatory protein TetR  23.76 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4592  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4223  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4607  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1477  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0628  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  20.43 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4382  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4721  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4577  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  24.22 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4626  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  26.49 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  22.96 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_0526  regulatory protein TetR  24.4 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  22.62 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3254  putative transcriptional regulator  21.56 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  25.19 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  28.17 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 256 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5361  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296046  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 243 aa  51.6  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 215 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4942  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261709  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  27.04 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
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NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  20.21 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
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NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_0558  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235529  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 240 aa  50.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  20.69 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  23.78 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_1436  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.940915  normal  0.193535 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013521  Sked_14590  transcriptional regulator, tetR family  35.29 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
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