164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1436 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1436  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.940915  normal  0.193535 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1265  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 199 aa  72  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  27.88 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  22.56 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  28.19 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  22.62 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  23.7 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1682  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.274254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 233 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  22.97 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3452  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000897017  hitchhiker  0.00397123 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 239 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 188 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  20.87 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  29.85 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  23.87 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0584  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 335 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 286 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  22.05 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  38.3 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  20.62 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5286  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 291 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>