84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1477 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1477  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4942  TetR family transcriptional regulator  88.48 
 
 		 191 aa  309  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1241  regulatory protein TetR  64.52 
 
 		 193 aa  198  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0907421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0546  regulatory protein TetR  56.68 
 
 		 188 aa  188  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0069  putative transcriptional regulator  55.25 
 
 		 202 aa  187  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.494217  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3254  putative transcriptional regulator  55.95 
 
 		 194 aa  168  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0242  regulatory protein, TetR  52.51 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3261  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 208 aa  140  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0526  regulatory protein TetR  45.9 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 243 aa  131  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33620  transcriptional regulator, tetR family  45.1 
 
 		 195 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.807824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3794  putative TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 232 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 247 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 268 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 235 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 210 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0304  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 210 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 205 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  43.64 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 205 aa  44.7  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  22.28 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 242 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  38.46 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  38.33 
 
 		 204 aa  42  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 212 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 233 aa  42  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 197 aa  42  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003710  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 262 aa  42  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 203 aa  41.6  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 225 aa  41.6  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 209 aa  41.2  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 199 aa  41.2  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 188 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>