27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3794 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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Replicon accession
Locus tag
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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3794  putative TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  407  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 243 aa  87.8  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
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NC_007333  Tfu_0069  putative transcriptional regulator  24.73 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.494217  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_3261  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0546  regulatory protein TetR  28.26 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_1477  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_3254  putative transcriptional regulator  25.61 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0242  regulatory protein, TetR  24.29 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_4942  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261709  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0526  regulatory protein TetR  25.84 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_1241  regulatory protein TetR  24.31 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0907421  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_33620  transcriptional regulator, tetR family  29.91 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.807824 
 
 
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NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A3419  transcription regulation protein  24.68 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.909274  normal  0.462694 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3326  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_014212  Mesil_1943  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  32.82 
 
 		 919 aa  43.9  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_3094  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.432559  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007530  GBAA_4721  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4577  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS4382  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
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