89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4942 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4942  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  370  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1477  TetR family transcriptional regulator  88.48 
 
 		 191 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1241  regulatory protein TetR  66.13 
 
 		 193 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0907421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0546  regulatory protein TetR  57.14 
 
 		 188 aa  181  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0069  putative transcriptional regulator  51.67 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.494217  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3254  putative transcriptional regulator  55.95 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0242  regulatory protein, TetR  51.41 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3261  TetR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0526  regulatory protein TetR  43.72 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3165  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 243 aa  122  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33620  transcriptional regulator, tetR family  46.2 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.807824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3794  putative TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 243 aa  51.2  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 235 aa  51.2  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  44.62 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 242 aa  48.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0360  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 228 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 268 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 210 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  32.68 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 193 aa  44.7  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0328  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 215 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478904  normal  0.0897822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 196 aa  44.7  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 215 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 255 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3434  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.746162  normal  0.0922012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3423  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.620682  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 247 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3486  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.500093  normal  0.130277 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  38.46 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003710  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0304  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 233 aa  42.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 216 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 210 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 224 aa  41.6  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 218 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 209 aa  41.2  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 213 aa  41.2  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 191 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 203 aa  41.2  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  41.2  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 210 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>