More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3228 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  396  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  96.91 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  96.39 
 
 		 194 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  95.88 
 
 		 194 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  96.39 
 
 		 194 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  95.88 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  96.81 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  96.81 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  96.81 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  96.28 
 
 		 188 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  26.04 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  21.32 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  22.8 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  20.48 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1977  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  21.31 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  21.55 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  19.51 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  22.51 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  19.19 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  21.91 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3000  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000368141  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  22.67 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  22.47 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  21.56 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  18.4 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  20.57 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5116  TetR family transcriptional regulator  19.88 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3845  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4386  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  19.35 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  23.3 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4396  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  21.26 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
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NC_011773  BCAH820_4770  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
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NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  28.21 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
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NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  19.77 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4761  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
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NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
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NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  20.31 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3727  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000227076 
 
 
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NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  18.71 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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