More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0985 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  454  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  41.29 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  27.72 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
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NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  25.87 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0743  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.803231 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
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NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
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NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
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NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
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NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  22.86 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
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NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
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NC_009921  Franean1_5867  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0832592  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
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NC_013441  Gbro_2181  regulatory protein TetR  25 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
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