More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3524 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  383  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  70.8 
 
 		 182 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 205 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  46.99 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  47.59 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 206 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 206 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 206 aa  154  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 206 aa  147  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  48.13 
 
 		 206 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 206 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 175 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 188 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 225 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 208 aa  88.2  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 231 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 237 aa  81.3  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4804  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0360919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  52.63 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  24.8 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3219  transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 247 aa  57.8  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  45.95 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  22.79 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  38.37 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 87 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  49.12 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
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NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
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NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  31.87 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
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