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for query gene CPS_1410 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  37.82 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  39.11 
 
 		 204 aa  121  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 220 aa  118  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  30.21 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  27.43 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  30.87 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  30.49 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  24.37 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
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NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  26.18 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_010338  Caul_1089  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
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NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
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NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
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NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  27.94 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 297 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  26.4 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0116  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  31.52 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 209 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  23.78 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 231 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  39.76 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
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NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 239 aa  51.2  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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