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for query gene Sde_0361 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  442  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
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NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0394  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509635  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  23.86 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  22.07 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  23.27 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
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NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
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NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
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NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
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NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_4372  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 187 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  0.0486392 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
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NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
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NC_007974  Rmet_4887  putative TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109337  normal  0.0985913 
 
 
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NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  20.88 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
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NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  25.87 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  21.71 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4644  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0446716 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4420  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010678  Rpic_4512  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.551086  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3947  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.354968 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3581  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428867  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
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NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
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NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
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NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
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NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 189 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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