More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1976 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 181 aa  356  8e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 180 aa  224  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 291 aa  84.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  32.14 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1681  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 217 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.371055  normal  0.828695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.66 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  54.9 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0620  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0611  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0633  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.97 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  37.21 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.39 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.39 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.39 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.39 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.39 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  43.06 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.67 
 
 		 213 aa  54.3  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 221 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 210 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 223 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 213 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  36.78 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  42.05 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 261 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 254 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 254 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 194 aa  52.4  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 254 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 254 aa  52.4  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.04 
 
 		 213 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 240 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 248 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.84 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 248 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 210 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 254 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 254 aa  52.4  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>