More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2488 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  57.73 
 
 		 199 aa  257  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 198 aa  214  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 198 aa  191  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 194 aa  144  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 196 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 196 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  36.55 
 
 		 196 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
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NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
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NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
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NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 197 aa  121  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
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NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 198 aa  111  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
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NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 194 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 188 aa  87.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 194 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 193 aa  85.1  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 188 aa  85.1  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  24.74 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
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NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
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NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  24.59 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0530  hypothetical protein  26.45 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
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NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
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NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
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NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
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