More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2858 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  430  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  46.96 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  49.24 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 198 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  42.51 
 
 		 201 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 198 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 202 aa  121  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 202 aa  118  7e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  39.26 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  36.98 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  39.63 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 342 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  39.53 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 196 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  54.44 
 
 		 211 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 198 aa  88.2  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  41.48 
 
 		 207 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8687  transcriptional regulator, TetR family  37.12 
 
 		 176 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12083  transcriptional regulator, TetR family protein  25.24 
 
 		 187 aa  52  0.000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  26.97 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  37.84 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 188 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  27.89 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 183 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 186 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 215 aa  48.5  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  24.88 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3975  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  39.66 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>