More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3921 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  70.35 
 
 		 224 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 198 aa  160  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  45.23 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 198 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  43.43 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  44.67 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 236 aa  131  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  34.21 
 
 		 226 aa  131  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 235 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 193 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 260 aa  125  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 342 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  33.16 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  31.47 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 200 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  30.81 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 207 aa  101  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 202 aa  84.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  31.06 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  46.74 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  23.12 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  27.46 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  27.46 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  27.46 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  27.46 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  27.46 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  27.46 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  27.46 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  27.1 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  31.29 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  26.92 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>