More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0070 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  406  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  53.09 
 
 		 196 aa  191  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  55.67 
 
 		 195 aa  188  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 198 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  44.5 
 
 		 193 aa  164  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  50.25 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  50.76 
 
 		 198 aa  160  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  39.36 
 
 		 226 aa  144  9e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 236 aa  132  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 233 aa  131  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 247 aa  127  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  39.38 
 
 		 213 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 342 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 213 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 213 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 221 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 200 aa  117  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 199 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 207 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  107  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  36.75 
 
 		 198 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  39.76 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 216 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  48.86 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  31.28 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  25.29 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  25.58 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  21.85 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  32.88 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  20.95 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
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NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
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NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  21.52 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
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NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
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NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
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NC_010322  PputGB1_3179  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30038  normal  1 
 
 
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NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
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