190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06958 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  408  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  85.64 
 
 		 196 aa  352  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 201 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 235 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 236 aa  97.8  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 342 aa  95.1  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  90.9  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  33.14 
 
 		 213 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 207 aa  89.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 247 aa  88.6  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 218 aa  88.2  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 269 aa  88.2  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 197 aa  87.8  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  85.1  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 199 aa  85.1  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 199 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  29.94 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  40.35 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  29.5 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  26.98 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  22.53 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  17.19 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  36.23 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  21.24 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 291 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 195 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>