81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1907 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  426  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  50.84 
 
 		 218 aa  154  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  44.71 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  44.63 
 
 		 198 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  44.63 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  40.35 
 
 		 213 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 199 aa  111  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  37.19 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  39.63 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 		 197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  39.5 
 
 		 202 aa  108  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 199 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 213 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 219 aa  101  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 236 aa  101  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  37.06 
 
 		 194 aa  101  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 260 aa  99.4  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 269 aa  99  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 193 aa  98.6  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 342 aa  98.2  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 199 aa  98.2  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 202 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 197 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 247 aa  95.9  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 200 aa  94.7  9e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 196 aa  87.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 198 aa  84.7  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  49.45 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  27.12 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  28.57 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 225 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  23.21 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0959  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 219 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.783426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 202 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>