More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3500 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2514  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.348132 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1470  putative transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 192 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596057  normal  0.840694 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4496  hypothetical protein  38.46 
 
 		 203 aa  101  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.621109  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5057  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 214 aa  98.6  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  39.02 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4737  putative transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 192 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.959543  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2431  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 198 aa  90.1  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2069  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4387  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4621  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1300  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.480052 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2784  putative transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3084  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.634756  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4946  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3766  hypothetical protein  30.41 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.108876  normal  0.0885521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1153  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.181492  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3867  putative transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 219 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000000371985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 280 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 239 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1758  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 232 aa  52  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000730158  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2002  putative transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 232 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.341745  normal  0.807142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 227 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  47.37 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 318 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 200 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 316 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  47.27 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 318 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 317 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 276 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 272 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 318 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 316 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 316 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 318 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 273 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  32.98 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 269 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  45 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 307 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 260 aa  49.7  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  38.57 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  33.77 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  28.57 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 220 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 199 aa  48.5  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 198 aa  48.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  41.82 
 
 		 246 aa  48.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 219 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  35.96 
 
 		 200 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  33.73 
 
 		 227 aa  47.8  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  25.86 
 
 		 226 aa  47.8  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8504  putative transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.919137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>