More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0479 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  45.88 
 
 		 223 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  46.39 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 225 aa  141  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 199 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0874  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0891  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0880  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  26.32 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 215 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  30.53 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 206 aa  72  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 196 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  29.83 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.63 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
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NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
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NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  29.47 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
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NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  27.62 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  25.35 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
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NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5028  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
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NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_011312  VSAL_I1242  transcriptional regulator, TetR-family  25.41 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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