286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5860 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  91.49 
 
 		 193 aa  348  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  90.43 
 
 		 193 aa  344  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  90.43 
 
 		 193 aa  344  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  74.87 
 
 		 193 aa  287  8e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 190 aa  147  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 193 aa  95.1  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  33.15 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 192 aa  88.6  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  33.92 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  32.75 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  32.95 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 193 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  28.09 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  30.18 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  30.17 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  30.43 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  28.98 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  26.55 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
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NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5953  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0308427  normal  1 
 
 
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NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  26.11 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
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NC_010557  BamMC406_5709  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.92684  normal  0.162375 
 
 
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NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.27 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 182 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
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NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  20.94 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  26.26 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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