More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0482 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  433  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  55.15 
 
 		 204 aa  221  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  53.17 
 
 		 205 aa  219  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  54.44 
 
 		 204 aa  201  6e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 199 aa  108  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 203 aa  104  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  31.58 
 
 		 198 aa  95.9  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 193 aa  95.1  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 196 aa  94.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 196 aa  89  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 192 aa  85.5  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  29.65 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  30.99 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
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NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
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NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
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NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  29.05 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
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NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
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NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  26.84 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  29 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  24.74 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  30.29 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  26.45 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 210 aa  62  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
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NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
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NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
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NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
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NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  26.24 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
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