More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3677 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  398  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  158  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  39.31 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 201 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 196 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 200 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 198 aa  112  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 196 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 198 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
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NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
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NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2955  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  22.64 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3345  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  21.91 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  23.43 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0531  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  22.36 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  26.74 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
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