More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4724 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  69.23 
 
 		 196 aa  266  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  65.03 
 
 		 192 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3906  TetR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0242743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  47.16 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 216 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 216 aa  147  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 216 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 188 aa  147  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 293 aa  147  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 304 aa  147  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 304 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  138  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 		 186 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 188 aa  101  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 218 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 205 aa  89  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 199 aa  87.8  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 195 aa  85.1  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 191 aa  85.1  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 190 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2897  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  29.23 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 203 aa  77.8  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  30.98 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  36.23 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 204 aa  72  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 193 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 188 aa  72  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 199 aa  72  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  27.03 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 200 aa  64.3  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
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NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
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