More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4533 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  204  7e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  48.45 
 
 		 200 aa  191  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 196 aa  169  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  45.93 
 
 		 194 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 198 aa  105  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 196 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 196 aa  94.4  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 196 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 196 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 196 aa  92  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 196 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1032  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
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NC_008044  TM1040_0178  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  27.81 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
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NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3753  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.02252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2508  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2003  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  23.81 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
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NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4065  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
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NC_007348  Reut_B4319  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_1088  transcriptional regulator, TetR family protein  29.59 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
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