More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2948 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  62.43 
 
 		 189 aa  208  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  46.39 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  51.04 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 194 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 194 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 194 aa  151  7e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 199 aa  144  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  45.65 
 
 		 200 aa  141  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  39.23 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  41.3 
 
 		 191 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 205 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 190 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 186 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 203 aa  107  9.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 186 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 193 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 191 aa  92  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 193 aa  91.3  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 193 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 212 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 193 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  32.56 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  36.98 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  22.68 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1297  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4264  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  34.71 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3453  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0161587  hitchhiker  4.69207e-17 
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0055  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.727514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1013  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1893  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3208  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000777782  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3234  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3462  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00233938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3487  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.418737  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0042  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  29.28 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_3448  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
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NC_006274  BCZK3140  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.404836  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
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NC_009720  Xaut_1146  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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