More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0541 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  38.19 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 194 aa  118  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 194 aa  84.7  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  30.43 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  28.72 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
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NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  33.53 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
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NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  31.32 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  23.3 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
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NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  27.87 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
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NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  26.34 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  23.2 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  25.41 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  28.22 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  25.65 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  26.04 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  22.61 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  24.69 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
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NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
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NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
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NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  26.29 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
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NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
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NC_003910  CPS_4749  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.590058  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  23.95 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
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