More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1416 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  407  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  65.57 
 
 		 196 aa  242  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  57.06 
 
 		 189 aa  202  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 205 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 600 aa  65.9  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  24.59 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  25.14 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.59 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  36.59 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.59 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.59 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.59 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  36.59 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  26.6 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  22.8 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  29.41 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1410  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  22.83 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  25.78 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  26.79 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0469  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  41.82 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24360  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  24.43 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>