More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5020 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  393  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  65.93 
 
 		 188 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  48.9 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  43.17 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 196 aa  96.3  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  26.67 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 195 aa  72  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 196 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1578  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
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NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  24.16 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2864  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1395  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  29.74 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2762  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2694  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357406 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  27.46 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
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NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
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NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
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NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  32.41 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  25.27 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
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NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
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NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
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NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
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