More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3998 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 245 aa  482  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 203 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  39.7 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 195 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 202 aa  92.4  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 191 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 191 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 189 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 191 aa  89.4  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 192 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 195 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 202 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  37.16 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  39.15 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  31.72 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 198 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 191 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  35.15 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 187 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 199 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 		 199 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  28.25 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3714  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.530873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  35.76 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  32.97 
 
 		 181 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  52.94 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  35.5 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  48.19 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 208 aa  67  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13188  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.166406 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  31.79 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  54.9 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
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NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  36.76 
 
 		 188 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
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NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
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NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
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NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
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NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
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NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
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NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
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