More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10440 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  423  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  43.68 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  40.46 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 211 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  38.51 
 
 		 201 aa  111  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  30.65 
 
 		 197 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  34.72 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 197 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  34.44 
 
 		 197 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 197 aa  91.7  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 201 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 198 aa  84.7  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 198 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  33.72 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  46.39 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  30.92 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  30.68 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  35.29 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  35.29 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  35.29 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  35.29 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  35.29 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  35.29 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  29.76 
 
 		 185 aa  62  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 332 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 200 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  24.3 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>