More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2292 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  65.59 
 
 		 186 aa  255  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  65.59 
 
 		 186 aa  255  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 497 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  29.76 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  20.51 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 332 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5116  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 770 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3160  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000883166 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3305  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 283 aa  53.9  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 216 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  28.24 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3430  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 240 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3078  regulatory protein, TetR  38.46 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.745436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 275 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  29.69 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3014  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 275 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 257 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1874  putative regulatory protein  41.18 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.885441  normal  0.710734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  25.2 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3254  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 224 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 225 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 277 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 244 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4399  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 197 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 317 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  19.87 
 
 		 220 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  22.88 
 
 		 200 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>