More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1736 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  100 
 
 		 197 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  77.55 
 
 		 197 aa  313  7e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  79.38 
 
 		 197 aa  309  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  73.44 
 
 		 198 aa  280  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  65.48 
 
 		 198 aa  271  3e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  54.82 
 
 		 197 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 197 aa  211  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 199 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  55.5 
 
 		 196 aa  187  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  48.96 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  48.96 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  49.24 
 
 		 196 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  51.45 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  44.57 
 
 		 199 aa  164  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  46.63 
 
 		 195 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 198 aa  154  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 205 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 198 aa  101  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 202 aa  99  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  34.44 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 222 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 225 aa  89  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  43.22 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 215 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 215 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 215 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  46.15 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  33 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  44.17 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  42.34 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  39.43 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  28.64 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  30.68 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 289 aa  61.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0332  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 310 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 271 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2181  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  46.03 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0944  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 330 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 253 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
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