More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5717 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  90.36 
 
 		 197 aa  358  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  79.38 
 
 		 197 aa  309  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  74.87 
 
 		 198 aa  289  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 198 aa  272  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  55.44 
 
 		 197 aa  222  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 197 aa  213  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 199 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  56.12 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 196 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  51.56 
 
 		 195 aa  181  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 199 aa  175  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  50.53 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  51.1 
 
 		 201 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 201 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  51.1 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 195 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32 
 
 		 211 aa  91.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 225 aa  91.3  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  84.3  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  31.16 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  32.99 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  39.17 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  36.9 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  29.45 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  32.18 
 
 		 192 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  30.28 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 310 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1326  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0115046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  45.45 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1248  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3550  putative transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 374 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3062  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000497782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>