More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3742 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  58.29 
 
 		 197 aa  184  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  53.97 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  51.87 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  38.15 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  50.43 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 209 aa  92.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 225 aa  91.7  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  35.5 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 222 aa  84.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  44.17 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  33.68 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  39.17 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.83 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  41.12 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  41.28 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  37.19 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  45.31 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.08 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.55 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.55 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.31 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  45.31 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.55 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.55 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.31 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.31 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.31 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.31 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.31 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.45 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.45 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.55 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.45 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.23 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.17 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.08 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.27 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  26.63 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  45.9 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  45.31 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  36.17 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>