More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3520 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  64.8 
 
 		 197 aa  274  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  66.67 
 
 		 197 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  65.48 
 
 		 197 aa  271  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  67.71 
 
 		 198 aa  272  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  46.11 
 
 		 197 aa  187  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  50.53 
 
 		 196 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 196 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  44.56 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 195 aa  158  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  47.4 
 
 		 201 aa  157  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  46.82 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 198 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 202 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 205 aa  99.8  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 225 aa  88.2  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  31.34 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  32.4 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  34.29 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  32.46 
 
 		 234 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 194 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  32.4 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32.17 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 182 aa  62  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  30.37 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  31.29 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  29.36 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  46.77 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5717  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3550  putative transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 374 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0101342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4612  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.657053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 187 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.28 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  29.7 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 271 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.28 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 310 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.28 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  26.28 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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