More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3992 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  73.58 
 
 		 216 aa  318  5e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  76.38 
 
 		 317 aa  303  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  72.22 
 
 		 330 aa  300  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  70.44 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  64.65 
 
 		 226 aa  282  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  69.59 
 
 		 221 aa  280  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  69.59 
 
 		 200 aa  276  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  65.07 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  69.54 
 
 		 205 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  64.08 
 
 		 215 aa  268  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  62.87 
 
 		 220 aa  266  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  63.96 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 212 aa  264  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 212 aa  264  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 212 aa  264  8e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  62.69 
 
 		 217 aa  263  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  63.92 
 
 		 197 aa  259  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 197 aa  258  7e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  62.38 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  61.81 
 
 		 211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  59.43 
 
 		 231 aa  251  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  62.76 
 
 		 207 aa  247  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  62.05 
 
 		 205 aa  244  6e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 		 220 aa  244  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  58.65 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  57.43 
 
 		 215 aa  234  5.0000000000000005e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  57.07 
 
 		 204 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 199 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 273 aa  210  1e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 228 aa  104  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  30.81 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 224 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 224 aa  92  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 221 aa  91.7  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 215 aa  88.2  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 195 aa  84.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  26.48 
 
 		 211 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  30.96 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 224 aa  72  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  50.85 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  31.91 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  42.67 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  46.05 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  27.36 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>